6种猪冠状病毒概述-猪冠状病毒是dna还是rna

众所周知，病毒是微生物的一种，其家族包含甚多。而冠状病毒就是其中一大类病毒的总称，因其最早发现这一病毒的包膜上存在许多棘突，病毒外观形似王冠而得名。冠状病毒在病毒分类上属套式病毒目冠状病毒科冠状病毒属。它们是具有囊膜，基因组为线性单股正链的RNA病毒。根据系统发育树，冠状病毒可分为四个属：α、β、γ、δ，其中β属冠状病毒又可分为四个独立的亚群A、B、C和D群。该类病毒均无交叉保护。其在自然界广泛存在，可以感染人、猪、其它哺乳类动物和鸟类，引起被感染者肠道和呼吸道疾病。

目前已知的猪的6种冠状病毒都属于冠状病毒亚科的α、β、δ冠状病毒属。它们包括猪传染性胃肠炎病毒（TGEV）、猪流行性腹泻病毒（PEDV）、猪德尔塔冠状病毒（PDCoV）、猪急性腹泻综合征冠状病毒（SADS-COV）。猪呼吸道冠状病毒（PRCV）和猪血凝性脑脊髓炎病毒（PHEV）。目前研究表明，猪的冠状病毒是不会感染人类的。

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猪肠道冠状病毒

猪肠道冠状病毒包括猪传染性胃肠炎病毒（TGEV）、猪流行性腹泻病毒（PEDV）、猪德尔塔冠状病毒（PDCoV）和猪急性腹泻综合征冠状病毒（SADS-COV）。它们具有高度的传染性，可引起猪的急性胃肠炎（新生仔猪最为严重），临床表现为腹泻、呕吐，脱水等症状，可引起仔猪大量死亡，其死亡率通常高达100%。而母猪发病率却不一，通常呈零星暴发（地方性）或大规模流行。截止目前，尚无针对任何猪肠道冠状病毒的特殊治疗方法。

（1）猪传染性胃肠炎病毒（TGEV）

猪传染性胃肠炎病毒（TGEV）于1946年在美国被鉴定，它是在猪上最早发现的冠状病毒。猪流行性腹泻病毒（PEDV）于1977年分离鉴定，此二者同属α属冠状病毒。其临床症状极为相似。

TGE有两种明显的流行病学形式：流行性和地方性。流行性的TGE在冬季表现更明显一些，而地方性的TGE在一个群体中持续存在，这个群体往往是由易感猪的不断涌入而延续的。它是原发性暴发的典型后遗症，常发生在有规律产仔的血清阳性动物身上（Stepanek等人，1979年）。在地方病群中，TGEV在成年猪中传播缓慢（Pritchard，1987年）。母猪大多具有时间抗性和无症状性，并将向其后代转移不同程度的被动母源性免疫。值得注意的是，用减毒活疫苗、灭活疫苗或亚单位疫苗对怀孕母猪进行肌肉注射、肠外注射或乳内注射并不能提供完全的保护，但可以有效降低仔猪死亡率（Brim等人，1994年）。TGE可能通过返饲使怀孕母猪（特别是在暴发后2周或更长时间内因产仔而产生的母猪）免疫迅速发展，并减少新生仔猪的损失。然而，它也可能导致其他病原体（可能存在于含有粪便/肠道内容物的TGEV中）传播到邻近的畜群。

（2）猪流行性腹泻病毒（PEDV）

猪流行性腹泻病毒（PEDV）从遗传学上讲，毒株分为两类：经典株（来自欧亚大陆的与原型CV777株基因相似的株）和新兴的PEDV株（Lin等人，2016年；Vlasova等人，2014年）。这两大类PEDV之间的重组体在其S基因中含有一组与经典毒株相同的缺失插入。它们被称为SINDEL株，在亚洲、欧洲和美国流通。此外，一些报道描述了在S蛋白的N-末端结构域（NTD）中有大量缺失（194-216AA）并被指定为SNTDdel型PEDV的其他不常见的PEDV变体（Diep等人，2017年；Oka等人，2014年；Suzuki等人，2015年）。不同于从肠道TGEV到呼吸性PRCV的组织嗜性改变，这些（SINDEL和S1NTF已被报道为缺失毒株）PEDV毒株保持其肠道偏好，但具有较低的毒力（Suzuki等人，2016年；Hou等人，2017年）。需要了解的是，中国发现了新的SINDEL毒株（Wang等人，2016b），说明经典和新兴毒株在中国共同流通。

PEDV感染1周以下的新生仔猪常因严重脱水而死亡，死亡率高达50~100%，每次暴发一般持续约3~4周；然而，在大型养殖场，在后备/母猪中有多个分离的单位和不同水平的母源免疫，暴发时间可能更长。妊娠母猪暴露于PEDV后，可提供足够的母源性免疫保护仔猪，PED的暴发也随之停止。急性暴发后，腹泻可能持续存在，并在断奶仔猪中反复出现，类似于地方性TGE形式（Martelli等人，2008年）。与TGEV一样，应采取适当的生物安全措施，避免将PED引入农场。PEDV疫苗成为预防和控制该病毒感染的必要条件。经典的PEDV疫苗未能保护猪免受与新出现的高致病性非SINDEL PEDV株相关的严重腹泻病（Lee，2015年）。妊娠母猪故意暴露于PEDV（返饲法）可促进母源性免疫的快速发展，从而缩短疾病在农场的病程和严重程度（Chattha等人，2015年）（如图1）。然而，返饲这种方法可能有助于其他传染源在整个农场的传播。有资料表明，与低剂量和模拟感染的母猪相比，给母猪注射高剂量的剧毒PEDV可显著提高其仔猪存活率（Langel等人，2016年）。这一新的发现表明，目前基于返饲的控制策略可以通过确保对怀孕母猪均匀施用高剂量PEDV来改进。由于缺乏PEDV特异性抗病毒药物，治疗的重点是缓解腹泻病。目前为止，常见的猪流行性腹泻疫苗包括灭活疫苗、弱毒疫苗、转基因植物疫苗、转基因病毒工程疫苗以及TGEV-PEDV二联苗等，这些疫苗对于防控起到了一定的效果。

图1 返饲后的母猪与后代

（3）猪德尔塔冠状病毒（PDCoV）

猪德尔塔冠状病毒（PDCoV）为δ冠状病毒属。该病毒2012年首次发现于中国香港的猪群中（Woo等，2012年）。2014年2月美国在腹泻仔猪和母猪的粪便中首次检测到PDCoV，随后，韩国和中国大陆也从腹泻猪的临床样品中检测到PDCoV。中国PDCoV株与全球PDCoV株具有较高的核苷酸同源性（>98.9%）。PDCoV的主要传播途径是粪口传播。粪便、呕吐物和其他受污染的粪便是病毒的主要来源。实验诱发的PDCoV腹泻持续5~10天，粪便病毒RNA排毒持续19天（Hu等人，2016年；Ma等人，2015年）。猪在疾病恢复后，通常会继续在粪便中排毒PDCoV RNA；因此，PDCoV的另一个可能的宿主可能是亚临床感染或恢复期携带者。据报道，猪只感染后其临床症状类似于猪流行性腹泻（PED），表现为仔猪、母猪水样腹泻和仔猪死亡。与PED的区别之一就是仔猪死亡率相对较低。对TGEV和PEDV的控制和预防所采取的疾病预防措施对PDCoV感染也有一定的参考价值。在并发或继发细菌感染的情况下，使用抗生素可能是有益的。在高死亡率的情况下，必须选择返饲技术来刺激母源性免疫和降低死亡率。此外，在PDCoV流行期间，必须实施严格的生物安全措施，以减少PDCoV通过受感染的媒介传播。全进全出系统和彻底消毒可以打破疾病循环。

（4）猪急性腹泻综合征冠状病毒（SADS-COV）

猪急性腹泻综合征冠状病毒（SADS-COV）为最新发现的猪冠状病毒，属于α属冠状病毒。2016年在中国广东清远的猪群中发现。2017年在中国首次报道（Gong等人，2017年），被认为是一种起源于蝙蝠的冠状病毒。2017年1月，在广东省的一个养猪场发现了SADS-CoV，随后迅速传播到其他三个养猪场，导致了猪场出现急性腹泻和仔猪迅速消瘦为特征猪急性腹泻综合征(SADS)的临床表现。SADS-CoV的症状类似于其他猪肠道冠状病毒如PDCoV和PEDV，但SADS-CoV比这些病毒危害更大，因为它在很短的时间内造成了将近25000头仔猪死亡，并导致更严重的经济损失。华南农业大学张祥斌团队对广东地区45个猪场的猪急性腹泻综合征冠状病毒流行病学研究表明：至少自2016年8月以来，中国猪群已经出现了SADS-CoV。与此同时，回顾性调查显示SADS-CoV的临床症状包括严重的急性呕吐和腹泻，导致小于5天龄的仔猪死亡，死亡率约为50%。感染率记录表明PEDV(78.25%)为猪腹泻的主要原因，这与之前的研究一致，PEDV一直被认为是引起猪腹泻的主要病原体。除PEDV外，SADS-CoV感染率居第二位(43.53%)，在猪中有明显的流行趋势。从这个结果也可知，SADS-CoV和PEDV同时存在于所有的SADA-CoV共感染样本中。这个需要引起从业者与临床兽医们的注意。它的流行率和对猪宿主的适应状况尚不是很清楚。目前此病毒未见有效的预防治疗方法。

（5）其它

有报道称在欧洲发现了一种致病性重组PEDV/TGEV新的肠道冠状病毒变种（猪肠道冠状病毒，SeCoV）（Akimkin等人，2016年；Belsham等人，2016年；Boniotti等人，2016年）。其临床表现与TGEV和PEDV感染类似。

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猪呼吸道冠状病毒（PRCV）

1984年在比利时猪群中发现了一株与仔猪呼吸道感染相关的猪传染性胃肠炎病毒（TGEV）突变体，命名为猪呼吸道冠状病毒（PRCV）。TGEV和PRCV的核苷酸和氨基酸序列的整体相似性为96~98%，表明PRCV是由TGEV进化而来的。PRCV基因组的两个特征可能解释了其组织取向的改变，包括暴发S基因N-末端缺失（621-681nt）导致S蛋白大小减少和ORF3的可变序列改变（Ballesteros等人，1997年；Sanchez等人，1999年）。实验感染后，鼻腔PRCV排毒通常持续4~6天。随着病毒中和（VN）抗体滴度的增加，肺部病变和临床症状随之消退（Atanasova等人，2008年）。任何年龄猪只都可以通过接触或空气传播感染PRCV。PRCV被认为是非致病性的，因为感染是非常轻微或亚临床的。其主要感染猪从而引起呼吸道症状。有研究报道称大部分猪场呈阳性状态。单纯性感染猪群往往处于亚临床症状，但是与其它细菌或病毒混合感染的情况下，该病的临床症状才明显。许多研究表明，感染PRCV的断奶仔猪再攻毒TGEV可以部分的起到免疫保护作用。杨乐乐等报道，PRCV与TGEV有交叉免疫作用。

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猪血凝性脑脊髓炎病毒（PHEV）

猪血凝性脑脊髓炎病毒（PHEV）于1962年分离鉴定，属于猪β冠状病毒，它是唯一的引起仔猪神经症状的冠状病毒。在世界范围内流行（Li等人，2016年）。它一般在仔猪中发病率高，特别是1~3周龄仔猪易患，仔猪死亡率20%~100%；而成年猪呈隐性感染。临床上在缺乏母源抗体的新生仔猪中，PHEV引起脑脊髓炎或以呕吐和消瘦为特征的疾病，另一种是以出现神经症状为主。临床诊断上又称为呕吐-消瘦病。国内最早报道于1985年，之后陆续有多个省份报道此病。有资料报道近年来在吉林与辽宁省猪群中存在较高的PHEV阳性感染率。目前，对于此病毒有灭活疫苗研制。

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总结

以上为目前在猪身上发现的6种冠状病毒。虽然它们在不断感染猪群（尤其是某些病毒存在重组或变异的情况下），但是猪场不同的感染表现以及防控方面往往不尽如人意，从而给生猪养殖带来了一定的经济损失。采用先进的生物安全措施和有效的疫苗防控，可以在一定程度上遏制相关冠状病毒引起的疾病。